Nur ein paar Schritte weiter von der Kirche Alt St. Thomä befindet sich die Kirche Neu St. Thomä, eine ehemalige Klosterkirche der Franziskaner (1233), die hier ihr erstes Kloster in Westfalen gründeten.
Bis auf den Chor und die Außenwände des Langhauses fiel die Kirche im zweiten Weltkrieg dem Bombenhagel zum Opfer, wurde danach aber in alter Form wieder aufgebaut. Einen Glockenturm hatte die ehemalige Minoritenkirche allerdings nie. Die Klostergebäude sind heute bis auf wenige Überreste verschwunden.
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